Ви переглядаєте архівну версію офіційного сайту НУЛП (2005-2020р.р.). Актуальна версія: https://lpnu.ua
Біоінформатика
Спеціальність: Фармацевтична біотехнологія
Код дисципліни: 7.162.01.M.20
Кількість кредитів: 5
Кафедра: Технологія біологічно-активних сполук, фармації та біотехнологія
Лектор: к.х.н., с.н.с., асистент Василюк Софія Володимирівна
Семестр: 2 семестр
Форма навчання: денна
Результати навчання:
• знання особливостей біомедичної інформації та методів її аналізу;
• знання будови та принципів роботи світових банків біомедичної інформації;
• знання засад і алгоритмів обробки та аналізу біомедичної інформації;
• знання головних методів роботи з генетичною інформацією та алгоритмів обробки біомедичних зображень;
• уміння використовувати існуючі комп’ютерні та інформаційні ресурси для аналізу та інтерпретації біологічних даних різного типу (послідовностей ДНК,РНК та білків, метаболічних шляхів та ін..)
• знання будови та принципів роботи світових банків біомедичної інформації;
• знання засад і алгоритмів обробки та аналізу біомедичної інформації;
• знання головних методів роботи з генетичною інформацією та алгоритмів обробки біомедичних зображень;
• уміння використовувати існуючі комп’ютерні та інформаційні ресурси для аналізу та інтерпретації біологічних даних різного типу (послідовностей ДНК,РНК та білків, метаболічних шляхів та ін..)
Необхідні обов'язкові попередні та супутні навчальні дисципліни:
пререквізити: біологія клітини; молекулярна біологія; біоінженерія (клітинна, генетична); генетика (загальна та молекулярна);
кореквізити: нано- та ДНК-технології; експересдіагностика та біодоступність ліків; біомоніторинг, біобезпека, біозахист та екоекспертиза;
кореквізити: нано- та ДНК-технології; експересдіагностика та біодоступність ліків; біомоніторинг, біобезпека, біозахист та екоекспертиза;
Короткий зміст навчальної програми:
Біоінформатика як наука. Організація живих систем на молекулярному рівні. Системна біологія. Природа і складності інтерпретації біологічних даних. Біоінформатичні бази даних та інструменти їх аналізу. Інструменти біоінформатики. Методи вирівнювання нуклеотидних і амінокислотних послідовностей. Матриці амінокислотних замін. Філогенетика. Комп'ютерний дизайн генних мереж. Біоінформатика як спосіб прискорення процесу створення лікарських препаратів.
Рекомендована література:
1. Нефедов Е., Субботина Т., Яшин А. Современная биоинформатика. Изд-во Телеком. – 2005.
2. Игнасимуту С. Основы биоинформатики. - М.-Ижевск: НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2007. - 320 с.
3. Глазко В.И., Глазко В.Г. Введение в ДНК-технологию и биоинформатику. – К.: Нора-принт, 2005. – 136 с.
4. Дурбин Р., Эдди Ш., Крог А., Митчисон Г. Анализ биологических последовательностей. – М. – Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных исследований, 2006. – 480 с.
2. Игнасимуту С. Основы биоинформатики. - М.-Ижевск: НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2007. - 320 с.
3. Глазко В.И., Глазко В.Г. Введение в ДНК-технологию и биоинформатику. – К.: Нора-принт, 2005. – 136 с.
4. Дурбин Р., Эдди Ш., Крог А., Митчисон Г. Анализ биологических последовательностей. – М. – Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных исследований, 2006. – 480 с.
Методи і критерії оцінювання:
• фронтальне усне опитування, письмові звіти з лабораторних робіт (20 балів)
• підсумковий контроль (80 балів, контрольний захід, екзамен): письмово-усна форма (80 балів).
• підсумковий контроль (80 балів, контрольний захід, екзамен): письмово-усна форма (80 балів).