Ви переглядаєте архівну версію офіційного сайту НУЛП (2005-2020р.р.). Актуальна версія: https://lpnu.ua
Банки даних для біотехнології
Спеціальність: Фармацевтична біотехнологія
Код дисципліни: 7.162.01.M.17
Кількість кредитів: 5
Кафедра: Технологія біологічно-активних сполук, фармації та біотехнологія
Лектор: к.х.н., с.н.с., асистент Василюк Софія Володимирівна
Семестр: 2 семестр
Форма навчання: заочна
Результати навчання:
• знання засад створення та принципів роботи баз даних в галузі біології;
• навики користування сучасними інформаційними ресурсами для навчання, наукової та професійної діяльності;
• знання особливостей біомедичної інформації та методів її аналізу;
• уміння отримувати інформацію з різних біологічних баз даних;
• навики використання пошукових систем біологічних баз даних.
• навики користування сучасними інформаційними ресурсами для навчання, наукової та професійної діяльності;
• знання особливостей біомедичної інформації та методів її аналізу;
• уміння отримувати інформацію з різних біологічних баз даних;
• навики використання пошукових систем біологічних баз даних.
Необхідні обов'язкові попередні та супутні навчальні дисципліни:
пререквізити: біологія клітини; молекулярна біологія; біоінженерія (клітинна,генетична); генетика (загальна та молекулярна);
кореквізити: нано- та ДНК-технології; експересдіагностика та біодоступність ліків; біомоніторинг, біобезпека, біозахист та екоекспертиза;
кореквізити: нано- та ДНК-технології; експересдіагностика та біодоступність ліків; біомоніторинг, біобезпека, біозахист та екоекспертиза;
Короткий зміст навчальної програми:
Бази даних і інструменти інформаційних технологій в біотехнологіїї.
Робота з науковою літературою: Google Scholar, Microsoft Academic Search, Publish or Perish, PubMed,Scopus, Mendeley. Інструменти біоінформатики. Набір інформації, що характеризує біополімери. Послідовності амінокислот і нуклеотидів як основна інформаційна складова біоінформатики. Формати файлів, що використовуються в біоінформатиці. Запис амінокислотних послідовностей та нуклеотидних послідовностей. Джерела біологічної інформації і бази даних в Інтернеті. Класифікація і типи баз даних. Проблеми баз даних: надмірність, наявність помилок, проблеми, пов'язані з відкритістю. Бази даних в галузі біології (GenBank – NCBI, EMBL, SwissProt, PDB - Protein Data Bank, KEGG та ін.). Вбудовані інструменти для роботи з базами даних в Інтернеті. Інтернет-інструменти для роботи з інформацією з біологічних баз даних. Поєднання інформації з різних баз даних, включаючи біологічні та бібліографічні. Інструменти для автоматизованого сполучення інформаційних обмінів з різними базами даних. Оцінка і механізми підвищення ефективності пошуку. Програмні засоби та Інтернет-сервіси для біоінформаційного аналізу. Інструменти для аналізу нуклеотидних і білкових послідовностей.
Рекомендована література:
1. Леск А.М. Введение в биоинформатику Издательство: Бином. Лаборато-рия знаний, 2009, 318с.
2. Основи біоінформатики. Бази даних молекулярної біології. Практикум / Укладачі: Горобець С.В., Горобець О.Ю., Лень Т.С. – К.:ВПК “Політехніка”, 2009. – 68 с.
3. Игнасимуту С. Основы биоинформатики. - М.-Ижевск: НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2007. - 320 с.
2. Основи біоінформатики. Бази даних молекулярної біології. Практикум / Укладачі: Горобець С.В., Горобець О.Ю., Лень Т.С. – К.:ВПК “Політехніка”, 2009. – 68 с.
3. Игнасимуту С. Основы биоинформатики. - М.-Ижевск: НИЦ "Регуляторная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2007. - 320 с.
Методи і критерії оцінювання:
• фронтальне усне опитування, письмові звіти з лабораторних робіт (20 балів)
• підсумковий контроль (80 балів, контрольний захід, екзамен): письмово-усна форма (80 балів).
• підсумковий контроль (80 балів, контрольний захід, екзамен): письмово-усна форма (80 балів).