Ви переглядаєте архівну версію офіційного сайту НУЛП (2005-2020р.р.). Актуальна версія: https://lpnu.ua
Комп'ютерні технології в промисловій біотехнології
Спеціальність: Біотехнології та біоінженерія
Код дисципліни: 6.162.02.E.104
Кількість кредитів: 5.5
Кафедра: Технологія біологічно-активних сполук, фармації та біотехнологія
Лектор: к.х.н., асистент Бучкевич Ірина Романівна
Семестр: 8 семестр
Форма навчання: денна
Результати навчання:
• знання програмування, володіння навичками роботи з комп'ютером;
• знання розрахунку біопроцесів аналітичними методами та математичне моделювання мікробіологічних процесів.
• уміння ідентифікації, формулювання і вирішення завдань створення та функціонування біотехнологічних виробництв;
• уміння визначати основні елементи системи забезпечення якості на виробництві та вживати організаційно-технічних заходів щодо її реалізації.
• знання розрахунку біопроцесів аналітичними методами та математичне моделювання мікробіологічних процесів.
• уміння ідентифікації, формулювання і вирішення завдань створення та функціонування біотехнологічних виробництв;
• уміння визначати основні елементи системи забезпечення якості на виробництві та вживати організаційно-технічних заходів щодо її реалізації.
Необхідні обов'язкові попередні та супутні навчальні дисципліни:
Інженерна та комп’ютерна графіка. Інформатика.
Вступ до фаху. Історія біотехнології та біоетика. Процеси та апарати біохімічної інженерії. Математичне моделювання мікробіологічних процесів
Вступ до фаху. Історія біотехнології та біоетика. Процеси та апарати біохімічної інженерії. Математичне моделювання мікробіологічних процесів
Короткий зміст навчальної програми:
Використання суперкомп'ютерів в біології. Пошук біотехнологічної інформації в мережі Інтернет. Конвергентні технології NBIC (nano-bio-info-cogno), як синергетична комбінація нанонауки і нанотехнологій, біотехнологій і біомедицини, інформаційних технологій і когнітивної науки. Комп'ютерні програми для побудови 2-D та 3-D структурних формул сполук: ACD-Lab, Hyper Chem, Isis Draw. Використання технологій професійної комп'ютерної графіки для візуалізації результатів наукових досліджень. Віртуальний скринінг, оцінка 2-D подібності. Програма PASS. Генерування 3-D моделей. Програмне забезпечення для молекулярного докінгу. Віртуальний скринінг методом QSAR. Поліпептидні ланцюги. Моделювання структури та динаміки макромолекул. Рентгеноструктурний аналіз білків. Фолдінг білків. Просторові структури молекул біополімерів і методи їх дослідження. Визначення просторової структури біологічних макромолекул, білків. Методи визначення первинних структур молекул ДНК, РНК і білків. Сучасні проблеми макромолекулярной кристалографії. Розпізнавання в первинній структурі біополімерів ділянок білка, у яких проходить кодування. Моделювання донора та акцептора різними комп'ютерними програмами. Обчислювальна екологія. Хвилі збудження в біологічних системах і кінематичний підхід до їх дослідження. Вирішення завдань розшифровки генетичної інформації, що закладена в біологічних послідовностях. Порівняльний аналіз інформаційних біополімерів.
Рекомендована література:
1. Кларк Т. Компьютерная химия. Пер. с англ. - М: Мир, 1990. - 381 с.
2. Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии / ред. В.Д. Лахно, М.Н. Устинина. – М. Инст. комп. иследований, 2002, 528 ст
2. Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии / ред. В.Д. Лахно, М.Н. Устинина. – М. Инст. комп. иследований, 2002, 528 ст
Методи і критерії оцінювання:
- Поточний контроль – лабораторні роботи (10 б.), практичні заняття (10 б.), РГР (30 б.).
-Підсумковий контроль – (50 балів, контрольний захід): письмова форма (50 балів).
-Підсумковий контроль – (50 балів, контрольний захід): письмова форма (50 балів).