Ви переглядаєте архівну версію офіційного сайту НУЛП (2005-2020р.р.). Актуальна версія: https://lpnu.ua

Комп'ютерні технології в промисловій біотехнології

Спеціальність: Біотехнології та біоінженерія
Код дисципліни: 6.162.02.E.104
Кількість кредитів: 5.5
Кафедра: Технологія біологічно-активних сполук, фармації та біотехнологія
Лектор: к.х.н., асистент Бучкевич Ірина Романівна
Семестр: 8 семестр
Форма навчання: денна
Результати навчання:
• знання програмування, володіння навичками роботи з комп'ютером;
• знання розрахунку біопроцесів аналітичними методами та математичне моделювання мікробіологічних процесів.
• уміння ідентифікації, формулювання і вирішення завдань створення та функціонування біотехнологічних виробництв;
• уміння визначати основні елементи системи забезпечення якості на виробництві та вживати організаційно-технічних заходів щодо її реалізації.
Необхідні обов'язкові попередні та супутні навчальні дисципліни:
Інженерна та комп’ютерна графіка. Інформатика.
Вступ до фаху. Історія біотехнології та біоетика. Процеси та апарати біохімічної інженерії. Математичне моделювання мікробіологічних процесів
Короткий зміст навчальної програми:
Використання суперкомп'ютерів в біології. Пошук біотехнологічної інформації в мережі Інтернет. Конвергентні технології NBIC (nano-bio-info-cogno), як синергетична комбінація нанонауки і нанотехнологій, біотехнологій і біомедицини, інформаційних технологій і когнітивної науки. Комп'ютерні програми для побудови 2-D та 3-D структурних формул сполук: ACD-Lab, Hyper Chem, Isis Draw. Використання технологій професійної комп'ютерної графіки для візуалізації результатів наукових досліджень. Віртуальний скринінг, оцінка 2-D подібності. Програма PASS. Генерування 3-D моделей. Програмне забезпечення для молекулярного докінгу. Віртуальний скринінг методом QSAR. Поліпептидні ланцюги. Моделювання структури та динаміки макромолекул. Рентгеноструктурний аналіз білків. Фолдінг білків. Просторові структури молекул біополімерів і методи їх дослідження. Визначення просторової структури біологічних макромолекул, білків. Методи визначення первинних структур молекул ДНК, РНК і білків. Сучасні проблеми макромолекулярной кристалографії. Розпізнавання в первинній структурі біополімерів ділянок білка, у яких проходить кодування. Моделювання донора та акцептора різними комп'ютерними програмами. Обчислювальна екологія. Хвилі збудження в біологічних системах і кінематичний підхід до їх дослідження. Вирішення завдань розшифровки генетичної інформації, що закладена в біологічних послідовностях. Порівняльний аналіз інформаційних біополімерів.
Рекомендована література:
1. Кларк Т. Компьютерная химия. Пер. с англ. - М: Мир, 1990. - 381 с.
2. Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии / ред. В.Д. Лахно, М.Н. Устинина. – М. Инст. комп. иследований, 2002, 528 ст
Методи і критерії оцінювання:
- Поточний контроль – лабораторні роботи (10 б.), практичні заняття (10 б.), РГР (30 б.).
-Підсумковий контроль – (50 балів, контрольний захід): письмова форма (50 балів).